Как и большинство районов Молдавской ССР, образован 11 ноября 1940 года с центром в городе Каушаны. До 16 октября 1949 года находился в составе Бендерского уезда, после упразднения уездного деления перешёл в непосредственное республиканское подчинение.

С 31 января 1952 года по 15 июня 1953 года район входил в состав Тираспольского округа, после упразднения окружного деления вновь перешёл в непосредственное республиканское подчинение. 9 января 1956 года в состав Каушанского района передана меньшая часть территории упраздняемого Кайнарского района. 30 марта 1962 года в Каушанский район передана почти половина территории упраздняемого Бендерского района. 23 декабря 1964 года из части территории Каушанского района образован Суворовский район.

С 1999 года по 2002 год, в рамках проводимой административной реформы, район являлся частью Бендерского уезда. После упразднения уездного деления, район вновь стал самостоятельной административной единицей. Тогда же в состав Каушанского района передана часть территории вновь упраздняемого Кайнарского района.